蒲辅周少时名启宇。光绪十四年（1888年）十二月生于四川梓潼县城西西溪沟（今潼江村）。
启宇七岁即读私塾。白日课读，晚间习字或听祖父讲《幼学琼林》、《千家诗》。启宇从小养成勤奋好学品质。
启宇十一岁涉猎诸子散文。《论语》多篇已能成诵。
1903年，蒲启宇十五岁，开始随祖父，父亲学医。白天侍诊，晚上读书。从《内经》、《难经》、《伤寒》、《本草》、《金匮》到《外台》、《千金》以及叶天士、吴鞠通、闫纯玺、李恒超、愈根初等诸家著作。祖父教诲，一读二思三临床。耳提面命，严格课导。每至深夜，不知疲倦埋头苦读。诸如《灵枢本神篇》的“肺气虚，则鼻塞 不利气少”。《伤寒论》中的“汗出不可令如水淋漓，如水淋漓，病必不除”。叶天士的“不可就认板法”。等等重点字句，又勾又圈，反复背诵。
1906年，启宇18岁出师，坐诊县城东街“杏林药堂”。梓潼贫困山区。光绪二十六年（1900年）以来，不是大旱，便是水涝。青壮年外出乞讨，老弱病残饿死病死不少。人民极端贫苦。瘟疫时时发生。启宇对就诊病人，一丝不苟，认真诊断，活人很多，小有名气。
一天，启宇从帝主宫（现川剧团处）前过，见一堆人，面带戚容。一妇人衣服蓝褛，跪在一小儿前抢天呼地。儿脸蜡黄，又瘦又小。旁吐一滩，双眼不睁，浑身抽搐。启宇一见，分开众人，顾不得肮脏，用长袍把病人一裹，直奔回杏林药堂。众人哗然。有认得的说：“好了，蒲老师来了，有救了”。街上人如鲫鱼过江，齐拥向杏林药堂。启宇将小儿平放，让伙计拿来碗和清油，手脚之麻利。采用刮沙法，用碗口沾点清油，从上至下自风池、风府刮至骶骨两旁；又从手弯，腿弯刮，过劂阴、太阴穴位。只见皮肤出现紫红点。病儿不再四肢抽搐，平缓过来。慢慢睁开眼来。围观的人们欢声雷动。小儿母亲“咚”的一下给启宇跪下，磕头叫：“菩萨，活菩萨”。从此，市面上传开了杏林药堂有个蒲“神医”。
1908年，启宇为感激病人的赞誉，表示他济世救人的志向，改启宇为辅周。取辅助贫弱，周济病人的意思。
1911年，蒲辅周人年青，侧隐心很重。看病不分时间，地点。有时路遇病人，田坎地角一坐，便拿脉处方。还叮咛如何煎药。平易近人，医术又高，很受县人欢迎。
1921年七月连日大雨，潼江水涨路阻，城墙倾倒四十余丈。庄稼被淹，米价飞涨。县城鸡市拐（现紫阳街）拥集大批灾民。蒲辅周早出晚归为灾民义诊，施药。
1932年，蒲辅周置田二十亩，创西河义渡。
1934年，蒲辅周又拿出节俭之资，买田五十亩创办“同济施医药社”，请名医免费为贫困者诊病，捡药。乡民拍手相庆。蒲辅周成为潼城百姓有口皆碑之人。
1935年，蒲辅周与弟子薛崇成来成都，住成都会馆。同年冬天，成都温病流行，病人拥堂塞铺。四十七岁的蒲辅周详细诊断，认定系“寒包火”，即用麻黄开表。可是当地“麻黄发汗过峻，成都人禀赋薄，禁不住发表”的观念根深蒂固。病人见方后不敢取药。改它药代替又无效。辅周思索再三，便将麻黄研末为引子发放。果然，经他看病的无不效验。于是名噪省城。
接三弟来信说，梓潼霍乱流行，一天死数十人。辅周面戚心悲。立即汇二百个大洋处方一张。要三弟将治霍乱药方抄写四处张贴。将汇款买药，半价发售，贫穷的分文不收。
1941年，蒲辅周五十三岁喜得第二子，取名志孝。此子禀赋酷似乃父。长大，辅周留身边传医。果然，而立之年志孝即成名乡梓。
是时，辅周积极支持从四川医学院毕业的弟子薛崇成走中西医结合道路，让其考入华西大学，并选择神经专业。辅周说：“若古人固步自封，今《本草》便只有一本了”。
1955年，中央根据毛泽东主席1954年6月作的“即时成立中医研究机构，罗致好的中医进行研究”批示，作出贯彻中医政策的指示。《人民日报》发表社论，卫生部成立了中医研究院，向各省征调著名中医，担负科研、教学、医疗重任。全国各地共调有30多位中医。蒲辅周是其中之一。
一到中国中医研究院，评级，杜自明等有著作评为一等一级。蒲辅周评为二等一级。四川去的老中医都知道蒲辅周医疗技术少与伦匹。杜自明等一再推辅周为一等一级。定板时，辅周谦虚地说：“按评级规定，我尚未著作，别打破原则。以后说，以后说”。一阵掌声，洋溢着领导和同志们的赞扬。
1956年，北京地区流行乙型脑炎，死亡率很高。儿童医院，第一传染病院都住满病人。许多医生仿效石家庄地区治疗乙脑经验，仍用白虎汤，结果屡试无效。人们大惑不解。甚至怀疑白虎汤对乙脑的疗效。后辅周往视。蒲辅周翻阅文献，通过客观仔细全面分析，认为去年石家庄地区发病，是因久晴无雨，天暑地热，属暑温偏热，采用的白虎汤，可辛凉透邪，清气泄热，切中病机。然而，今年北京地区发病，久雨少晴，天暑地湿，势必温热交蒸。人得病虽是暑温，但应偏湿。蒲辅周投药改用湿温法诊治。遣用杏仁滑石汤，三仁汤等芳香化理，通阳利湿之方剂，大获神效。使许多垂危病人起死回生，挽救了大量患者的生命。
1958年，一产后血崩不止的妇女，虽经注射及口服药物，输血，刮宫等措施治疗，八周后仍血块及浓汁流出。面唇苍白，声低气怯。身痛肢麻，肤肌甲错，面目四肢浮肿，六脉微细。请辅周会诊。辅周诊为流血过多，气血两虚，冲任受损，六脉失统，升降失和，营卫不谐，气不帅血，血不固气，已属危笃症候。辅周细问知其尚能进薄米汤一碗，胃气尚存，还有运药剂之能。便予固气止血剂九付，血流减少，食欲转好。又改投黄芪建中汤加党参、当归、阿胶以补气生血，调和营卫，一剂而血止。续进气血双补及血肉有情之品，复还其旧，竟全愈。病家感激之至，蒲先生蜚声中外。
蒲辅周被卫生部破格晋升为一等一级。
辅周七十岁在中研院收弟子高辉远，徐振盛、薛伯寿。他对学生说：“过去老师送学生三件礼物，草鞋一双，雨伞一把，灯笼一个。不论路程远近，刮风下雨，白天黑夜，都要去出诊。以救人为当务之急。绝不能因路远，天雨，夜间就不去了”。并说：“医疗经验是从实践中积累起来的。我带学生有两点要求：一是多读书，二是多临症。以理论指导临床实践，以临床实践碰到的问题再来学理论。要刻苦钻研技术，有渊博知识。要上知天文，下知地理，中知人事。融汇贯通，学以致用。俗话说‘不入虎穴，焉得虎子’。学习中医也是这样，不下苦功钻进去，就无所得。”接着他举张仲景“勤求古训，博采众长”结合自已医疗实践，写成《伤寒杂病论》等名人例子，教育学生要勤学不倦。并因材施教。不同学生安排课程不一。要学生多提问题，否则便责之没学或学之不深。要学生超过老师。果然，加之两年后收的陈鼎棋，不负辅周教导，均成大器。
1960年，蒲辅周七十二岁当选第三届全国政协常委。任广安门医院内科主任。有时晚间政协有活动，他搭公共汽车前往。同仁问为何不向院里要车。他说：“现在汽油缺少，节省点汽油，可以用于国家建设”。
1964年，蒲辅周诊余还学习《毛泽东选集》等政治书籍。周总理知他高龄看书困难，为使他更多了解国内外大事，把从日本归来，带回的半导体收音机赠与先生。
往常一样，西花厅给同总理看完病，总理总爱与辅周摆两句。大多垂询中医弘扬与发展问题。今天，总理却问他：“你给我开的药为什么特别灵？”辅周知道，周总理指他患癃闭之疾，许多医生一筹莫展，他给治愈了。辅周说：“别人把你当总理医，我把你当病人医。总理的病非医生可医，病人的病自是医生可医的”。总理哈哈大笑。邓大姐送出两截呢子给辅周。蒲辅周望着芸窗闪亮，纤尘不飞的西花厅说不出的激动。建议周总理每天吃一个玉米面窝窝头，以增强脾胃功能。周总理连说：“好，好。”并坚持做了。
1965年，蒲辅周当选为第四届全国政协常委。任中国中医研究院副院长，国家科委中医专题委员。
1966年，蒲辅周七十七岁，任中医研究院党委委员、中华医学常务理事、中国农工民主党中央委员、中央领导同志保健医师。他侧重老年病研究，探索老年体质的特殊性，老年病症的多样性，老年用药的规律性。他写了许多病例、临床体会。他的总概句就是：“征服老年病要做到辨证准、立法慎、选方精、用药稳。”
第二年，0烈火熊熊，他医好偷偷上门求治的名演员赵某，激怒“-”，要批斗，被周总理制止。
1969年，蒲辅周会诊一肝炎患者。肝功能虽转正常，但因肺部感染咳嗽，血象高，血沉快，24天发热不退。历用多种抗生素和中药，都无效。蒲老见其汗出多，微恶寒等。舌质艳红，有裂纹。脉弦大按之无力。断为气阴两伤，治以固卫养阴，甘温酸敛，甘麦大枣汤合玉屏风合剂化裁。经治医师怕停抗生素出意外，病人又拒服抗生素，医师与家属商定，将抗生素佯装蒲老中药的“药引子”，让其服用。服蒲老中药后，第三天体温正常。经治医师说“药引子即抗生素，要继续用。”怎料患者拿出一纸袋说：“药引子全在这里。情况转好，体温下降，全是蒲老中药的作用。”西医顿显窘迫和尴尬。连北京高年资的西医均为折服。认为中医药不但能治慢性病，而且善于治急性病。称蒲辅周取得的是震惊医坛的显赫治迹。
1971年，周总理在全国卫生工作会议上说：“蒲老学习了马列主义、毛泽东思想，唯物主义的东西多了，唯心主义的东西少了。他的医学是讲辩证法的。”周总理指示：“蒲老是真才实学的医生。要很好总结他的医学经验，这是一笔宝贵的财富。”卫生部和中医研究院遵照周总理指示，组织学生先后整理及出版了《蒲辅周医案》、《蒲辅周医疗经验》、《中医对几种妇女病的治疗方法》等书。后来，他爱子蒲志孝又整理了《蒲辅周医话》。
1975年1月，全国第四届人大会召开，蒲辅周当选为人大代表。
蒲老年近九旬，可谓高寿。他十分重视老年保健。他说：“老年人尤其要使足下暖，这对血液循环有好处。饮食有节，多吃五谷杂粮。不可过饱，亦不可忍饥。饭后缓行百步。药补不如食补。服药以冀长生，何异痴人说梦。服药不节欲，亦自伤生。保持思想乐观，是减少疾病重要因素。”他上午上班，下午会诊。心挂教学、科研、临床、学习。超负荷运行，终于病倒了。
四月二十九日，一颗杏坛巨星殒落了。蒲辅周与世长辞。享年八十七岁。